在安装时以及以后每隔一定时间，要由有资质的专业人员按照规定对每一台生物安全柜的整体运行性能进行生物的和物理的认证，以检查其是否符合国家及国际的性能标准。生物安全柜的检测主要包括物理学检测喝生物学检测两个方面，其中：
安全柜防护效果的物理学评估应该包括:
①.安全柜的整体、HEPA过滤器的泄漏,
②.空气向下流动的速率、进口空气的速率,
③.负压/换气次数,
④.气流的稳定性（烟雾特征）,
⑤.以及警报和自控（互锁）系统.
⑥.漏电
⑦.照度
⑧.紫外线强度
⑨.噪声
⑩.震动性的测试。
生物学评估包括:
①.对个体保护效果
②.对环境保护效果
③.样品保护试验
④.交叉污染试验。